İftira ve maksatlı soruşturmalarla görevlerinden edilen askerlerin bir çoğu da görevlerine yeniden dönmeye başladı. Birbirinden ilginç hikayeleri bulunan bu askerlerden biri de tuğgeneralliğe terfi ederek İstanbul İl Jandarma Alay Komutanı olarak atanan Kıdemli Kurmay Albay Hüseyin Kurtoğlu oldu.   Soruşturma açıldı  Kurtoğlu, Ağustos 2010’da Kurmay Albay Hamza Celepoğlu’nun yerine İstanbul’a Jandarma Alay Komutanı olarak atanmıştı. Ergenekon soruşturmalarının en aktif süreci olan 2008-2010 yılları arasında İstanbul Alay Komutanı olan Celepoğlu, Bingöl İl Jandarma Komutanlığı’na atandı. Kurtoğlu görevine başladıktan sonra çeşitli soruşturmalara maruz kaldı. 2012’de yargılandığı bir davadan da mahkûm oldu.  Özgür Balcan, Silivri Cezaevi’nde çeşitli suçlardan tutukluydu. Babası 2011’de vefat etti. Cezaevi Balcan’a babasının cenazesine katılması için izin verdi. Balcan, Jandarma nezaretinde Tekirdağ’a geldi ve cenazeye katıldı. Mevzuata göre, kendi evinde veya yakınlarında kalabilirdi. Ancak Jandarma, Balcan’ın dışarıda konaklamasını güvenli bulmadı ve Tekirdağ Cezaevi’ne getirdi.  Balcan döndükten sonra da evinde geçirmesi gereken zamanı cezaevinde geçirdiğini belirterek suç duyurusunda bulundu. Aralarında İstanbul İl Jandarma Alay Komutanı Kurmay Albay Hüseyin Kurtoğlu’nun da bulunduğu dört subay, bir astsubay ve bir uzman çavuş hakkında savcılıkça soruşturma açıldı.  Aleyhinde cemaate yakın mecralarda sık sık haberler çıkan Kurtoğlu doğrudan alakasının olmadığı bir konuda bu kez sanık olmuştu. Dava 27 Haziran 2012’de karara bağlandı. Balcan şikayetinden vazgeçti ama mahkeme hem sevki yapan subayları hem de onların bağlı olduğu Kurtoğlu’nu suçlu bularak 2 yıl 6 ay hapis cezası verdi.  2 yıl sonra beraat  Kurmay Albay Kurtoğlu, 2012 Ağustos Şurası’nda generallik sırasındaydı ancak bu nedenle terfi edemedi. Selefi ve terfi sırasındaki rakibi Hamza Celepoğlu ise aynı şurada Tuğgeneral oldu ve Adana Jandarma Bölge Komutanı olarak atandı. Kurtoğlu’nun cezası Yargıtay tarafından onayladı. Ardından 14. Ceza Dairesi toplandı ve ceza bozuldu, 2 yılın ardından beraat etti.  Celepoğlu ise Adana Jandarma Bölge Komutanı olarak MİT TIR’larına yapılan şaibeli operasyonların emrini veren komutan olarak adını duyurdu. Bu operasyonla ilgili soruşturma kapsamında tutuklandı.  Darbecilerin görevlendirme listesinde ise tekrar ortaya çıktı. Bu arada Kurtoğlu tekrar aktif göreve döndü, ceza verilerek uzaklaştırıldığı İstanbul İl Jandarma Alay Komutanlığı’na 15 Temmuz’un ardından geri döndü. Son Şûra’da Tuğgeneralliğe terfi etti, aynı Şûra’da Celepoğlu da TSK’dan ihraç edildi.